CGI ファイルはどのフォルダに転送すればよいのでしょうか？
CGI ファイルは/cgi-binフォルダに転送してください。
/httpdocsフォルダでも動作致しますが、その場合/httpdocsフォルダに
.htaccessファイルに下記のように記述して転送して下さい。
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Options +ExecCGI
AddHandler cgi-script .cgi
AddHandler cgi-script .pl
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※サーバー設定時に、弊社で上記の.htaccessを転送しますのでどのディレクトリでもＣＧＩは動作します。
※ディレクトリのパーミッションは、755にして下さい。（777はサーバエラーになります）